Créée en octobre 1998, à l'initiative des 331 signataires de son appel fondateur, et sous l'impulsion de Jacques Kergoat, la Fondation Copernic s'inscrit résolument dans la lutte contre le libéralisme ambiant, y compris au sein de la gauche française. « Les marchés ne sont pas la démocratie : bien au contraire, tout concourt à ce que s'instaurent à travers les marchés des cohérences et des initiatives, forgeant un ordre mondial qui fait fi de la liberté des peuples et des citoyens, et de leurs besoins. » affirme notamment l'appel.
Elle a mis en place des groupes de travail qui font le point sur les problèmes de sociétés et proposent des démarches ou des solutions alternatives. Des Notes concernant en particulier les retraites, la fiscalité, le plein emploi, la citoyenneté, la refondation sociale, l'immigration? en sont issues. D'autres groupes travaillent sur la bioéthique, la géostratégie, le logement social? Un bulletin périodique présente les diverses activités de la Fondation et aborde des thèmes de fond et d'actualité. La Fondation Copernic publie également Politique, revue européenne de débats. Des partenariats avec ATTAC, Raison d'agir et d'autres forces de la gauche alternative ont régulièrement lieu.
La principale originalité de la Fondation Copernic est sa pratique du pluralisme : pluralisme politique, syndical, associatif ; pluralisme des idées et des écoles de pensée ; pluralisme dans la composition des groupes de travail. Toute note de la Fondation est amplement discutée, retravaillée, le débat interne prévalant sur tout dogmatisme.